Botallo se narodil v Piemontu v Asti, ale svůj život spojil s francouzským prostředím. Byl osobním lékařem francouzského krále Jindřicha III. Zabýval se léčením střelných poranění, je po něm pojmenována i léčebná metoda (ductus Botalli), jedná se o krevní oběh mezi plicní tepnou a aortou.